保安值班睡觉被罚1000元不合法。依据《行政处罚法》，罚款是行政处罚，需由行政机关实施。非行政机关罚款，可能侵犯员工权益，造成劳动关系紧张。
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不合法。处理方式：1.轻微首次，口头警告并记录在案；2.多次或情节较重，依据公司规章制度扣绩效奖金；3.严重违规，可按程序解雇并告知理由。
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处理保安值班睡觉，常见方式有警告、扣奖金等。选择时应考虑公司规定、员工行为性质及后果。轻微违规可警告，严重或屡教不改可考虑扣奖金等。